Выбрасывать дверь не надо.
Учитывая высокое качество производства дверей "Гардиан" расточка отверстий, скорее всего, свидетельство некачественной установки.
Расточка влияет на то, что в будущем, если дверь просядет (вероятность 50%), то регулировать ее дальше расточкой отверстий уже не будет возможности и придется переустанавливать.
Однако, переустановка двери после отделки проема будет весьма дорогостоящей, поэтому переустановку желательно потребовать сейчас. Уверен, что представительство "Гардиан" пойдет Вам на встречу в этом вопросе. Репутация дороже переустановки!
Хотя, может случиться, так, что дверь и не просядет, тогда ни регулировки, ни переустановки не потребуется. Но лучше не рисковать.