Риск возникновения проблем при смене цилиндра минимальный.
Точно так же, как и перекодировке сувальдника

Из того, что слышал от сервисников: ситуаций, где блокируется корпус при самостоятельной замене цилиндра, по количеству сопоставимо с теми, когда как-то умудряются заблокировать сувальдник при перекодировки.